المحتوى
- ما هو النمط الجيني والنمط الظاهري؟
- شرح التنميط الجيني لفيروس نقص المناعة البشرية
- شرح فيروس نقص المناعة البشرية Phenoytyping
- متى يتم إجراء اختبار المقاومة الجينية؟
عندما يحدث فشل العلاج ، يجب اختيار تركيبات الأدوية البديلة من أجل قمع هذه المجموعة الجديدة من الفيروس المقاوم. اختبار المقاومة الجينية يساعد في تسهيل ذلك من خلال تحديد أنواع الطفرات المقاومة في "مجموعة الفيروسات" لدى الشخص ، مع التأكد من مدى تعرض هذه الفيروسات للعوامل المحتملة المضادة للفيروسات القهقرية.
يتم استخدام أداتين أساسيتين لاختبار المقاومة الجينية في فيروس نقص المناعة البشرية: مقايسة النمط الجيني لفيروس نقص المناعة البشرية و ال مقايسة النمط الظاهري لفيروس نقص المناعة البشرية.
ما هو النمط الجيني والنمط الظاهري؟
بالتعريف ، فإن النمط الجيني هو ببساطة التركيب الجيني للكائن الحي ، بينما النمط الظاهري هو الخصائص أو السمات التي يمكن ملاحظتها لهذا الكائن الحي.
تعمل مقايسات النمط الجيني (أو التنميط الجيني) عن طريق تحديد التعليمات الموروثة داخل الترميز الجيني للخلية أو الحمض النووي. تؤكد فحوصات النمط الظاهري (أو النمط الظاهري) التعبير عن تلك التعليمات تحت تأثير الظروف البيئية المختلفة.
في حين أن الارتباط بين النمط الجيني والنمط الظاهري ليس مطلقًا ، يمكن أن يكون التنميط الجيني في كثير من الأحيان تنبئيًا للنمط الظاهري ، خاصة عندما تمنح التغييرات في الشفرة الجينية التغييرات المتوقعة في السمات أو الخصائص - كما في حالة تطوير مقاومة الأدوية.
من ناحية أخرى ، يؤكد التنميط الظاهري "هنا والآن". يهدف إلى تقييم رد فعل الكائن الحي على تغييرات معينة في الضغط البيئي - مثل عندما يتعرض فيروس نقص المناعة البشرية لأدوية مختلفة و / أو تركيزات دوائية.
شرح التنميط الجيني لفيروس نقص المناعة البشرية
يعد التنميط الجيني لفيروس نقص المناعة البشرية بشكل عام أكثر التقنيات شيوعًا المستخدمة في اختبار المقاومة. الهدف من الفحص هو اكتشاف طفرات جينية محددة في هفوة بول منطقة الفيروس ' الجينوم (أو الكود الجيني). هذه هي المنطقة التي يتم فيها ترميز إنزيمات النسخ العكسي والبروتياز والإنزيمات - أهداف معظم الأدوية المضادة للفيروسات القهقرية - في سلسلة الحمض النووي.
من خلال تضخيم جينوم فيروس نقص المناعة البشرية أولاً باستخدام تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) ، يمكن لفنيي المختبرات تسلسل (أو "خريطة") جينات الفيروس باستخدام تقنيات اكتشاف الطفرات المختلفة.
يتم تفسير هذه الطفرات (أو تراكم الطفرات) من قبل الفنيين الذين يحللون العلاقة بين الطفرات التي تم تحديدها وقابلية الفيروس المتوقعة للأدوية المختلفة المضادة للفيروسات القهقرية. يمكن أن تساعد قواعد البيانات على الإنترنت من خلال مقارنة تسلسل الاختبار مع تسلسل النموذج الأولي للفيروس "من النوع البري" (أي فيروس نقص المناعة البشرية الذي لا يحتوي على طفرات مقاومة).
يتم استخدام تفسير هذه الاختبارات لتحديد مدى حساسية الأدوية ، حيث يمنح عدد أكبر من الطفرات الرئيسية مستويات أعلى من مقاومة الأدوية.
شرح فيروس نقص المناعة البشرية Phenoytyping
يقيس النمط الظاهري لفيروس نقص المناعة البشرية نمو فيروس نقص المناعة البشرية لدى الشخص في وجود دواء ، ثم يقارن ذلك بنمو فيروس بري من النوع المتحكم فيه في نفس الدواء.
كما هو الحال مع فحوصات النمط الجيني ، تعمل اختبارات النمط الظاهري على تضخيم منطقة gag-pol في جينوم HIV. يتم بعد ذلك "تطعيم" هذا القسم من الشفرة الجينية على استنساخ من النوع البري تكنولوجيا الحمض النووي المؤتلف. يستخدم الفيروس المؤتلف الناتج لإصابة خلايا الثدييات في المختبر (في المختبر).
ثم يتم تعريض العينة الفيروسية لتركيزات متزايدة من مختلف الأدوية المضادة للفيروسات الرجعية حتى يتم تحقيق 50٪ و 90٪ كبت الفيروس. ثم تتم مقارنة التركيزات بالنتائج المأخوذة من عينة المراقبة من النوع البري.
توفر تغييرات "الطية" النسبية نطاق القيمة الذي يتم من خلاله تحديد مدى حساسية الدواء. يعني التغيير بأربعة أضعاف أن هناك حاجة إلى أربعة أضعاف كمية الدواء لتحقيق كبت فيروسي مقارنةً بالنوع البري. كلما زادت قيمة أضعاف ، كلما كان الفيروس أقل عرضة لدواء معين.
ثم يتم وضع هذه القيم ضمن النطاقات السريرية الدنيا والعليا ، مع القيم العليا التي تمنح مستويات أعلى من مقاومة الأدوية.
متى يتم إجراء اختبار المقاومة الجينية؟
في الولايات المتحدة ، يتم إجراء اختبار المقاومة الجينية بشكل تقليدي على المرضى الساذجين للعلاج لتحديد ما إذا كان لديهم أي مقاومة "مكتسبة" للأدوية. تشير الدراسات في الولايات المتحدة إلى أن ما بين 6٪ و 16٪ من الفيروسات المنقولة ستكون مقاومة لعقار واحد على الأقل من مضادات الفيروسات القهقرية ، في حين أن ما يقرب من 5٪ سيكون مقاومًا لأكثر من فئة واحدة من الأدوية.
يستخدم اختبار المقاومة الجينية أيضًا عند الاشتباه في مقاومة الأدوية لدى الأفراد الخاضعين للعلاج. يتم إجراء الاختبار أثناء تناول المريض لنظام العلاج الفاشل أو خلال أربعة أسابيع من توقف العلاج إذا كان الحمل الفيروسي أكبر من 500 نسخة / مل. يُفضل اختبار النمط الجيني عمومًا في هذه الحالات لأنها تكلف أقل ، ولها وقت استجابة أسرع ، وتوفر حساسية أكبر لاكتشاف خلائط من الفيروسات من النوع البري والفيروس المقاوم.
يُفضل عمومًا الجمع بين اختبار النمط الظاهري والاختبار الوراثي للأشخاص ذوي المقاومة المعقدة والمتعددة للأدوية ، خاصةً لأولئك المعرضين لمثبطات الأنزيم البروتيني.